RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569950.1

VPS35-211, Transcript of VPS35, retromer complex component, humanhuman

TSL 5

Gene VPS35, Length 1,096 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS35-211ENST00000569950 C3orf56Q8N813 242 aa7.16□□□□□ -1.26
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VPS35-211ENST00000569950 DTD1Q8TEA8 209 aa7.16□□□□□ -1.26
VPS35-211ENST00000569950 RAX2Q96IS3 184 aa7.16□□□□□ -1.26
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VPS35-211ENST00000569950 IGHV3-48P01763 117 aa7.14□□□□□ -1.27
VPS35-211ENST00000569950 IGHV3-23P01764 117 aa7.14□□□□□ -1.27
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VPS35-211ENST00000569950 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.12□□□□□ -1.27
VPS35-211ENST00000569950 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
VPS35-211ENST00000569950 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
VPS35-211ENST00000569950 A0A0G2JLM5 398 aa7.11□□□□□ -1.27
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VPS35-211ENST00000569950 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.11□□□□□ -1.27
VPS35-211ENST00000569950 CCL24O00175 119 aa7.11□□□□□ -1.27
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