RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560311.1

IRF9-208, Transcript of interferon regulatory factor 9, human

TSL 2

Gene IRF9, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CTDSPL	O15194	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CYB5B	O43169	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	OR2C1	O95371	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	AKR1C2	P52895	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	MFAP2	P55001	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CADM3	Q8N126	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	THYN1	Q9P016	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	LGALS9	O00182	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TGOLN2	O43493	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311		P0C879	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	FOLR2	P14207	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CD81	P60033	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311		Q8N1Y9	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	MCFD2	Q8NI22	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311		X6R8D5	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311		K7EIM0	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ATG12	O94817	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	CLEC3B	P05452	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	UCP1	P25874	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	SP6	Q3SY56	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311		Q56UQ5	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	PRRT1	Q99946	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRF9-208	ENST00000560311	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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