RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 LTBP2Q14767 1821 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 HIST1H3AP68431 136 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 GPR146Q96CH1 333 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 AMELYQ99218 206 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 OR2C1O95371 312 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 UCP1P25874 307 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 FOXE3Q13461 319 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 HLA-DQB1P01920 261 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 DAD1P61803 113 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 TSTD3H0UI37 97 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 LINC00477Q96M19 166 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 C10orf111Q8N326 155 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 OTORQ9NRC9 128 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 C15orf32Q32M92 178 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 J3QR89 54 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 NTF3P20783 257 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 EMP1P54849 157 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 NHLH2Q02577 135 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 SEC11AP67812 179 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 PRELID3AQ96N28 172 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRB-209ENST00000550857 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 HIST3H3Q16695 136 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 ASCL4Q6XD76 172 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 COTL1Q14019 142 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM42Q69YG0 159 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-209ENST00000550857 FMC1Q96HJ9 113 aa6.61□□□□□ -1.35
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