RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 C7orf71A4D174 169 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 H3BRM9 83 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 GRPP07492 148 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 COX8AP10176 69 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ZXDAP98168 799 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 GTF3C1Q12789 2109 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 HIGD1CA8MV81 97 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 G3V4G9 280 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 C15orf65H3BRN8 121 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 HTR1DP28221 377 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 C2orf83Q53S99 150 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 MDP1Q86V88 176 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 SVIPQ8NHG7 77 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ZNF492Q9P255 531 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 MED12Q93074 2177 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 C9orf118A6NHY6 69 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 PRCDQ00LT1 54 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CR1LQ2VPA4 569 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ZNF503Q96F45 646 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 C9orf172C9J069 976 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 F2RL2O00254 374 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 SIVA1O15304 175 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CAMPP49913 170 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 LINC01545Q5VT33 79 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 DDB2Q92466 427 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 TNFRSF14Q92956 283 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ABI3Q9P2A4 366 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 A0A1B0GW15 77 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 hDV102S1A0JD36 115 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 K7EP34 96 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CHEK1O14757 476 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 MGST3O14880 152 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 COX7A2P2O60397 106 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CSN1S1P47710 185 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 SRYQ05066 204 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 SSX8Q7RTT4 187 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ZNF329Q86UD4 541 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 Q8TCH9 128 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 PAXXQ9BUH6 204 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 APOA2P02652 100 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CELA3BP08861 270 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 RBPJQ06330 500 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 HSD52Q0P140 79 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 PSG3Q16557 428 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 FMC1Q96HJ9 113 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 GPR82Q96P67 336 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 DLL1O00548 723 aa8.84□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 P01737 135 aa8.84□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
LMO3-215ENST00000537304 CD69Q07108 199 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms