RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 HCCSP53701 268 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 DLX6P56179 175 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 AP3S2P59780 193 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MED21Q13503 144 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 EDDM3AQ14507 147 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RGNQ15493 299 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF726P1Q15940 193 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 NDUFA5Q16718 116 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 BSXQ3C1V8 233 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 GID4Q8IVV7 300 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 C6orf223Q8N319 242 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 Q8N402 240 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OR6T1Q8NGN1 323 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OR9G1Q8NH87 305 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM106AQ96A25 262 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 KCTD7Q96MP8 289 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ABCG5Q9H222 651 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ABCB9Q9NP78 766 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RASL12Q9NYN1 266 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF222Q9UK12 451 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MED31Q9Y3C7 131 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PKHD1P08F94 4074 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD65E5RJM6 399 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 K7EMT4 169 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 GABRPO00591 440 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 BIRC5O15392 142 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MPZL2O60487 215 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PLIN3O60664 434 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PTTG1O95997 202 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CD3GP09693 182 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OR4E1P0C645 316 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OCM2P0CE71 109 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 SLC2A1P11166 492 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 HLA-GP17693 338 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 F2RP25116 425 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OR1E2P47887 323 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 HIST1H3AP68431 136 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CDK6Q00534 326 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PRDX4Q13162 271 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MADCAM1Q13477 382 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ASAH1Q13510 395 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF79Q15937 498 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 DRAM2Q6UX65 266 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 SMIM15Q7Z3B0 74 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OAFQ86UD1 273 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 FRZBQ92765 325 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IFT46Q9NQC8 304 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC42Q9Y546 428 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 HSPG2P98160 4391 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 COPEO14579 308 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ADAP1O75689 374 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OXTP01178 125 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-11P01762 117 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 FABP1P07148 127 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CD7P09564 240 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IFI30P13284 250 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 HSD11B1P28845 292 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms