RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 LMX1AQ8TE12 382 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 GPR146Q96CH1 333 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 STARD4Q96DR4 205 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 IP6K3Q96PC2 410 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 ACER3Q9NUN7 267 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 CELA1Q9UNI1 258 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 MAST2Q6P0Q8 1798 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 CDH23Q9H251 3354 aa3.12□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PRE2 83 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SIGLEC16A6NMB1 481 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 C9JCJ5 164 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 H7C1C5 153 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 ARPC5O15511 151 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 IGKV1D-33P01593 117 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 IGKV1-33P01594 117 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 DSCR10P59022 87 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 TAS2R45P59539 299 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 LCN6P62502 163 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 FKBP1CQ5VVH2 108 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 GPR119Q8TDV5 335 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SSR3Q9UNL2 185 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 NLRC5Q86WI3 1866 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 MYH13Q9UKX3 1938 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 OTOFQ9HC10 1997 aa3.11□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 LRRC37AA6NMS7 1700 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SCN1AP35498 2009 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 DOCK6Q96HP0 2047 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 A0A0J9YY10 115 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 A0A1B0GX78 115 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 NDUFC2O95298 119 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 PPBPP02775 128 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 RBP1P09455 135 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 PPIBP23284 216 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 ATP6V0CP27449 155 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 CRABP1P29762 137 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 MPV17P39210 176 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 GNG11P61952 73 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 OR4K13Q8NH42 304 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 PDFQ9HBH1 243 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 LAMB1P07942 1786 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 A6NED7 52 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 AIPO00170 330 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 PLA2G10O15496 165 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 TFPTP0C1Z6 253 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 CISD3P0C7P0 127 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 GZMHP20718 246 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 AKR1C2P52895 323 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 OR8G1Q15617 311 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 WDR59Q6PJI9 974 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 SLC7A6Q92536 515 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 BORCS5Q969J3 196 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 LYSMD1Q96S90 227 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms