RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 TLCD2A6NGC4 264 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 PATE3B3GLJ2 98 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 C10orf142B7Z368 130 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC17A2O00624 439 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 EFNA2O43921 213 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV4-34P06331 123 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 OR9G9P0C7N8 305 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 CR2P20023 1033 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 BTCP35070 178 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 PLA2G5P39877 138 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 LPAR6P43657 344 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 GALR1P47211 349 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 TGIF1Q15583 401 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM201AQ5SY85 155 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 C17orf64Q86WR6 236 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 OR4F4Q96R69 305 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 EMC6Q9BV81 110 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ACACBO00763 2458 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 KNTC1P50748 2209 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 RP1P56715 2156 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 DEDDO75618 318 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 MT-ND6P03923 174 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 CXCL1P09341 107 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A6P12236 298 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 PSMB8P28062 276 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF134P52741 427 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ARL16Q0P5N6 197 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 RRN3P1Q2M238 152 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 Q5XG85 94 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF534Q76KX8 674 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 C10orf111Q8N326 155 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A45Q8N413 288 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 RASL10AQ92737 203 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 KLK6Q92876 244 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 TVP23CQ96ET8 276 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 GFI1Q99684 422 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-214ENST00000497648 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 J3QQQ9 107 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 SPINT2O43291 252 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 SNCGO76070 127 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 GPANK1O95872 356 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 APOC2P02655 101 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 LIFP15018 202 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 MYOD1P15172 320 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 GPX3P22352 226 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 CD38P28907 300 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 CX3CL1P78423 397 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 HLA-DRB3P79483 266 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 COL10A1Q03692 680 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 OR7A5Q15622 319 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 ATOH7Q8N100 152 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 COPS9Q8WXC6 57 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 NAA60Q9H7X0 242 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 OARD1Q9Y530 152 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM202A6NGA9 273 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 SHISA9B4DS77 424 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF732B4DXR9 585 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms