RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	OR2B8P	P59922	312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	LYG2	Q86SG7	212 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SLC35G3	Q8N808	338 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	GPR146	Q96CH1	333 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	NUDT15	Q9NV35	164 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0B4J293	547 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0B4J2A0	478 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1B0GW64	132 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	DBX1	A6NMT0	343 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	C15orf61	A6NNL5	157 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TEX22	C9J3V5	150 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	DHRS2	Q13268	280 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344		Q6ZRM9	215 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	OR5B3	Q8NH48	314 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	PKHD1	P08F94	4074 aa		10.4	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	HINT2	Q9BX68	163 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	COA4	Q9NYJ1	87 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0J9YWU9	116 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344		H3BUA1	57 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	ST8SIA3	O43173	380 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	DEFA5	Q01523	94 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0G2JLM5	398 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	IFNA17	P01571	189 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	TRBV12-3	P01733	135 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	CRYGC	P07315	174 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	HOXB5	P09067	269 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	AREG	P15514	252 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	PSMB6	P28072	239 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	NMS	Q5H8A3	153 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1B0GU03	582 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	IL5	P05113	134 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	REG1A	P05451	166 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	OR13C7	P0DN81	318 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	CTRB1	P17538	263 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	PRCD	Q00LT1	54 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	SMCO1	Q147U7	214 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	PEMT	Q9UBM1	199 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	DHFR	P00374	187 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	PRH1	P02810	166 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A6	P12236	298 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM3-208	ENST00000489344	DEFA4	P12838	97 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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