RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 HLA-DQA1P01909 254 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 AREGP15514 252 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 KIR2DS2P43631 304 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 MUC15Q8N387 334 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 OSTCQ9NRP0 149 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 CACNA1GO43497 2377 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 M0R1B8 84 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 SPRY3O43610 288 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 DDB2Q92466 427 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 M0QZ24 198 aa14.77□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 FAM201AQ5SY85 155 aa14.77□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 VHLLQ6RSH7 139 aa14.77□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.77□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 OR4S2Q8NH73 311 aa14.77□□□□□ -0.04
SSR4-209ENST00000482902 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 MT-CO2P00403 227 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 IGLL1P15814 213 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 SELENOVP59797 346 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 HELTA6NFD8 242 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 C15orf61A6NNL5 157 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 H0YJW9 148 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 APCSP02743 223 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 STPG3Q8N7X2 389 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 DEFB124Q8NES8 71 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 HCFC1P51610 2035 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 LHBP01229 141 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 CGB3P0DN86 165 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 CGB7P0DN87 165 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 CRYBB3P26998 211 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 SLAQ13239 276 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TBR1Q16650 682 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 RHOGP84095 191 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 ISLRO14498 428 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 NPY1RP25929 384 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 OR4A47Q6IF82 309 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 PIP4P1Q86T03 277 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 IGLV2-8P01709 118 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 VAMP3Q15836 100 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TNXAQ16473 311 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 Q56UQ5 140 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 OR8B2Q96RD0 313 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.74□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 GLRXP35754 106 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TIGITQ495A1 244 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TEPPQ6URK8 271 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 NEUROG1Q92886 237 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 ENY2Q9NPA8 101 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 ERASQ7Z444 233 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.73□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 LINC00869P0C866 280 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 MYOD1P15172 320 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-209ENST00000482902 HINT2Q9BX68 163 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms