RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2CO00762 179 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 ARPC5O15511 151 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SPINT2O43291 252 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 IFNA4P05014 189 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 FOLR2P14207 255 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CXCL2P19875 107 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 IL15RAQ13261 267 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 MORN2Q502X0 79 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 FAM219AQ8IW50 185 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 LGI3Q8N145 548 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 LRTM2Q8N967 370 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 BVESQ8NE79 360 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 C5orf30Q96GV9 206 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 C2orf50Q96LR7 162 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CLCC1Q96S66 551 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 NMES1Q9C002 83 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 GNG12Q9UBI6 72 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 FBXL17Q9UF56 701 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.31□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 HMSDA8MTL9 139 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 IGLL5B9A064 214 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 H0YIZ8 118 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 ST8SIA5O15466 376 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TSC22D2O75157 780 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 MPC2O95563 127 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CA2P00918 260 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 F2RP25116 425 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 UCP1P25874 307 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 APOC4P55056 127 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 HTD2P86397 168 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TM4SF20Q53R12 229 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SLC35G3Q8N808 338 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 OR51H1Q8NH63 302 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 USMG5Q96IX5 58 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM56Q96MV1 263 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RNF126Q9BV68 326 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 MFFQ9GZY8 342 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 OR2D2Q9H210 308 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 COMMD9Q9P000 198 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 MBD2Q9UBB5 411 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 JPT1Q9UK76 154 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.3□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 L7N2F9 121 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 M0R2N4 97 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RGS13O14921 159 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 YPEL1O60688 119 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CDS2O95674 445 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 IFNA21P01568 189 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CT45A6P0DMU7 189 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CT45A5P0DMU8 189 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CT45A7P0DMV0 189 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SLC25A4P12235 298 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 PSMB6P28072 239 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 MFAP2P55001 183 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SRPXP78539 464 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 FGL1Q08830 312 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RAB32Q13637 225 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 FXYD3Q14802 87 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 OPCMLQ14982 345 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 PLGLAQ15195 96 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 PSG5Q15238 335 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 YPEL2Q96QA6 119 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RNF5Q99942 180 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 AGMATQ9BSE5 352 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms