RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 MCUBQ9NWR8 336 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TENM3Q9P273 2699 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM25EA8MYX2 175 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM229AH3BQW9 127 aa5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 TGOLN2O43493 480 aa5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 AKR1C2P52895 323 aa5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 XP32Q5T750 250 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1P1Q8NH06 330 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT14Q96FL9 552 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM56Q96MV1 263 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TSC22D3Q99576 134 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRT1Q99946 306 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 MLXQ9UH92 298 aa5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G10O15496 165 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 DHFRP00374 187 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 MT-CO2P00403 227 aa5.27□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 CTSGP08311 255 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf88P0DMB2 117 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.27□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 PLET1Q6UQ28 207 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35G3Q8N808 338 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.27□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.27□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.26□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 A8MWP6 167 aa5.26□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q56UQ5 140 aa5.26□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N3U1 123 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.26□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 THYN1Q9P016 225 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 PEMTQ9UBM1 199 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 MPTX1A8MV57 137 aa5.25□□□□□ -1.57
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