RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.23□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 RNF222A6NCQ9 220 aa11.23□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 PRSS46E5RG02 174 aa11.23□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 H3BUA1 57 aa11.23□□□□□ -0.61
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SFTA3-201ENST00000418548 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.23□□□□□ -0.61
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SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 SULT1A1P50225 295 aa11.23□□□□□ -0.61
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SFTA3-201ENST00000418548 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.23□□□□□ -0.61
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SFTA3-201ENST00000418548 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.23□□□□□ -0.61
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SFTA3-201ENST00000418548 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 SLC35B1P78383 322 aa11.22□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
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SFTA3-201ENST00000418548 OR2F1Q13607 317 aa11.21□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
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SFTA3-201ENST00000418548 RNF152Q8N8N0 203 aa11.21□□□□□ -0.61
SFTA3-201ENST00000418548 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.21□□□□□ -0.61
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SFTA3-201ENST00000418548 S100A11P31949 105 aa11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 CD69Q07108 199 aa11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 FOXE3Q13461 319 aa11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 TEX38Q6PEX7 206 aa11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 NECAP1Q8NC96 275 aa11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 GGACTQ9BVM4 153 aa11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.2□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 A0A0D9SG52 128 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 FNDC10F2Z333 226 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 K7EIM0 57 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 OR2J3O76001 311 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 NDUFB8O95169 186 aa11.19□□□□□ -0.62
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SFTA3-201ENST00000418548 HBG1P69891 147 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 HBG2P69892 147 aa11.19□□□□□ -0.62
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SFTA3-201ENST00000418548 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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SFTA3-201ENST00000418548 ATP6V1FQ16864 119 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 MISP3Q96FF7 219 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 MS4A10Q96PG2 267 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 KLK15Q9H2R5 256 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.19□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.18□□□□□ -0.62
SFTA3-201ENST00000418548 FAM223BA6NKX1 122 aa11.18□□□□□ -0.62
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