RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
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C4orf48-201ENST00000409248 OR1N2Q8NGR9 330 aa16.08■□□□□ 0.16
C4orf48-201ENST00000409248 OR1P1Q8NH06 330 aa16.08■□□□□ 0.16
C4orf48-201ENST00000409248 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
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C4orf48-201ENST00000409248 NDUFB8O95169 186 aa16.02■□□□□ 0.16
C4orf48-201ENST00000409248 CXCL3P19876 107 aa16.02■□□□□ 0.16
C4orf48-201ENST00000409248 VAMP2P63027 116 aa16.02■□□□□ 0.16
C4orf48-201ENST00000409248 RAB32Q13637 225 aa16.02■□□□□ 0.16
C4orf48-201ENST00000409248 REC114Q7Z4M0 266 aa16.02■□□□□ 0.16
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C4orf48-201ENST00000409248 ZP3P21754 424 aa16.01■□□□□ 0.15
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C4orf48-201ENST00000409248 CXorf58Q96LI9 332 aa16.01■□□□□ 0.15
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C4orf48-201ENST00000409248 FAM209BQ5JX69 171 aa16■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 SPANXN5Q5MJ07 72 aa16■□□□□ 0.15
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C4orf48-201ENST00000409248 PVRIGQ6DKI7 326 aa16■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF343Q6P1L6 599 aa16■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 VN1R17PQ8TDU5 208 aa16■□□□□ 0.15
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C4orf48-201ENST00000409248 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 H3BP45 60 aa15.99■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 OVOL1O14753 267 aa15.99■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 RLN2P04090 185 aa15.99■□□□□ 0.15
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C4orf48-201ENST00000409248 SLURP1P55000 103 aa15.99■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.99■□□□□ 0.15
C4orf48-201ENST00000409248 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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