RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYCE1Q8N0S2 351 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q8N402 240 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNBD2Q96M20 576 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 MCM3APO60318 1980 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A0D9SG52 128 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACOX3O15254 700 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 LYZL6O75951 148 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 MGST1P10620 155 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H2BOP23527 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H2BBP33778 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPINK7P58062 85 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H2BDP58876 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H2BCP62807 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 RHEBQ15382 184 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST2H2BEQ16778 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPINK9Q5DT21 86 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf137Q5JT78 98 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEFB125Q8N687 156 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAJC9Q8WXX5 260 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H2BHQ93079 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H2BNQ99877 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H2BMQ99879 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERICH2A1L162 156 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 SSNA1O43805 119 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 TYMSP04818 313 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 COX6A1P12074 109 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 GUK1Q16774 197 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIR17HGQ75NE6 70 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 TOPBP1Q92547 1522 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP192Q8TEP8 1941 aa-0.16□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.16□□□□□ -2.43
RNU6-38P-201ENST00000384085 PQLC2LA1A4F0 135 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCL25O15444 150 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 PROSCO94903 275 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV1-5P01602 117 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL12P30050 165 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6ZS49 121 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRINAQ7Z429 371 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 C4orf3Q8WVX3 66 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRRT1Q99946 306 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIXL1Q9H2W2 232 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCCP43146 1447 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 IQCF5A8MTL0 148 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 PFDN6O15212 129 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2B3O76000 313 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCL1BO95988 128 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 UCHL3P15374 230 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 MARCKSL1P49006 195 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM74A1Q5RGS3 127 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf195Q5TG92 126 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLECL1Q8IZS7 167 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 C3orf56Q8N813 242 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 TLNRD1Q9H1K6 362 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAD50Q92878 1312 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 MED12Q93074 2177 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV3A0A0B4J244 114 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 FABP12A6NFH5 140 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV3-1P01715 115 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEFB113Q30KQ7 82 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM156Q8N614 296 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 TERB2Q8NHR7 220 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITFG2Q969R8 447 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 TP73-AS1Q9UF72 201 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1B0GV50 99 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAAHO00519 579 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYL12AP19105 171 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 KDELR1P24390 212 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 HBA1P69905 142 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00575Q6W349 94 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLPP5Q8NEB5 264 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10J5Q8NHC4 309 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 C3orf18Q9UK00 162 aa-0.19□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms