RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.99□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 C11orf52Q96A22 123 aa14.99□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 C5orf30Q96GV9 206 aa14.99□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 HAND1O96004 215 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 C3AR1Q16581 482 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 TBR1Q16650 682 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 NPY1RP25929 384 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 OR8B2Q96RD0 313 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 TAAR6Q96RI8 345 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 ST20Q9HBF5 79 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 OSTCQ9NRP0 149 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.98□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 OR4C46A6NHA9 309 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 MC5RP33032 325 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 SSTR5P35346 364 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 MAGEA5P43359 124 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 STPG3Q8N7X2 389 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 OR4A16Q8NH70 328 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 TMEM45BQ96B21 275 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 GP6Q9HCN6 339 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 MFAP2P55001 183 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 OR1C1Q15619 314 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.97□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 DNPH1O43598 174 aa14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 OR9G9P0C7N8 305 aa14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 SMAGPQ0VAQ4 97 aa14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 HES4Q9HCC6 221 aa14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PKP3-201ENST00000331563 hDV102S1A0JD36 115 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 C7orf71A4D174 169 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 OR10J4P0C629 311 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.96□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 LINC00473A8K010 186 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 J3QT63 122 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 PRR31Q5SQ13 230 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 FAM231BA6NCW3 169 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 RAB9AP51151 201 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 RAB31Q13636 194 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 SIGMAR1Q99720 223 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 IZUMO1RA6ND01 250 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 C12orf77C9JDV5 145 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 ISLRO14498 428 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 CAMPP49913 170 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 LTC4SQ16873 150 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 HBZP02008 142 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 PLP2Q04941 152 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 MED12LQ86YW9 2145 aa14.94□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 C2orf70A6NJV1 201 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 FCGR3BO75015 233 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 TEPPQ6URK8 271 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 RFESDQ8TAC1 157 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PKP3-201ENST00000331563 PKIBQ9C010 78 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms