RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 OR4C46A6NHA9 309 aa11.97□□□□□ -0.49
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PTPRN-201ENST00000295718 K7ESF4 209 aa11.97□□□□□ -0.49
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PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.93□□□□□ -0.5
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PTPRN-201ENST00000295718 RNF138Q8WVD3 245 aa11.93□□□□□ -0.5
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PTPRN-201ENST00000295718 TSKUQ8WUA8 353 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 FAM168AQ92567 244 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 JPT1Q9UK76 154 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 NRN1LQ496H8 165 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 COX19Q49B96 90 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-201ENST00000295718 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.92□□□□□ -0.5
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