RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283206.8

TMEM87B-201, Transcript of transmembrane protein 87B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMEM87B, Length 5,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87B-201ENST00000283206 ERASQ7Z444 233 aa11.67□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 HIST1H4GQ99525 98 aa11.67□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.67□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 TIMP3P35625 211 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 FOXF2Q12947 444 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 TBR1Q16650 682 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 REC114Q7Z4M0 266 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 C15orf61A6NNL5 157 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 LYNX1P0DP58 116 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 BTCP35070 178 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 ASIPP42127 132 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 ATP5G3P48201 142 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 A0A1B0GUT8 65 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 SLC17A3O00476 420 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 C18orf12Q96KH6 178 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 C7orf71A4D174 169 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 H7C1H1 209 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 IGHV3-11P01762 117 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 THBDP07204 575 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM131CQ96AQ9 280 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 IL36BQ9NZH7 164 aa11.66□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 BIVMQ86UB2 503 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 IGHV1-46P01743 117 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 TFF1P04155 84 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 DNLZQ5SXM8 178 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 LY6DQ14210 128 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 DMRTA2Q96SC8 542 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 THADAQ6YHU6 1953 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 KCNS1Q96KK3 526 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 RNF126Q9BV68 326 aa11.65□□□□□ -0.54
TMEM87B-201ENST00000283206 SCN5AQ14524 2016 aa11.65□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 TAS2R60P59551 318 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 FMC1Q96HJ9 113 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 PPP1R17O96001 155 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 IGKV1D-12P01611 117 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 LRTM2Q8N967 370 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 NABP1Q96AH0 204 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 ID3Q02535 119 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 RAMP3O60896 148 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 PRELID3AQ96N28 172 aa11.64□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 SRRM5B3KS81 715 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 NPFFO15130 113 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 GAS1P54826 345 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 Q9H3A6 140 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 PI4KAP42356 2102 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 IL18BPO95998 194 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 CD24P25063 80 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 TUBA4BQ9H853 241 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 LINC00587B1AMM8 73 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 CTAG1AP78358 180 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 LY6G6FQ5SQ64 297 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 GFI1Q99684 422 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 A0A0G2JMZ2 1700 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 LTBP1Q14766 1721 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 A0A0A6YYD4 124 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 OR11H12B2RN74 326 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 MPZP25189 248 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 Q6AWC8 147 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 OR11H1Q8NG94 326 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 OR11H2Q8NH07 326 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 COPS9Q8WXC6 57 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 A8MXK9 166 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.63□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.62□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.62□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 MYOD1P15172 320 aa11.62□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 TNFRSF14Q92956 283 aa11.62□□□□□ -0.55
TMEM87B-201ENST00000283206 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms