RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637083.1

CLN8-212, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-212ENST00000637083 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 PPP5D1E7EU14 171 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 FSTL3O95633 263 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 GCHFRP30047 84 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 TAS2R45P59539 299 aa9.87□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 IMMP2LQ96T52 175 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 RNF2Q99496 336 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 NABP2Q9BQ15 211 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.87□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 IGFBP2P18065 325 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 ATP5G3P48201 142 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 CD69Q07108 199 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 C1orf159Q96HA4 380 aa9.87□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 NDUFB4O95168 129 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 TRGC1P0CF51 173 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 CA7P43166 264 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 LGALS7P47929 136 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 SSX2Q16385 188 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 LINC01551Q86U37 167 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 SSX3Q99909 188 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 MYOD1P15172 320 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 AREGP15514 252 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 CHRNB4P30926 498 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 LCN2P80188 198 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 CTSZQ9UBR2 303 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-212ENST00000637083 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 LINC00869P0C866 280 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 NPPCP23582 126 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 GAMTQ14353 236 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 FRZBQ92765 325 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 OR10J1P30954 320 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 KLRB1Q12918 225 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 NECAP1Q8NC96 275 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 C11orf52Q96A22 123 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 POLEQ07864 2286 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-212ENST00000637083 FCN3O75636 299 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 RBP4P02753 201 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 TYMSP04818 313 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 REG1BP48304 166 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 MUC15Q8N387 334 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 NIT2Q9NQR4 276 aa9.83□□□□□ -0.84
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CLN8-212ENST00000637083 C9JCJ5 164 aa9.83□□□□□ -0.84
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CLN8-212ENST00000637083 TEX45Q8NA69 505 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 OR5T1Q8NG75 326 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 SFRP2Q96HF1 295 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 IGF2RP11717 2491 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 OR5G3P0C626 314 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 SELENOTP62341 195 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-212ENST00000637083 MMD2Q8IY49 270 aa9.82□□□□□ -0.84
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