RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 IGKV1D-39P04432 117 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 REG1AP05451 166 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CLEC3BP05452 202 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CBLN1P23435 193 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 UCP1P25874 307 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 PIGPP57054 158 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 SPCS2Q15005 226 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 PLET1Q6UQ28 207 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 FAM219AQ8IW50 185 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 OR2C3Q8N628 320 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 OR4A16Q8NH70 328 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 RCHY1Q96PM5 261 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 K7EIM0 57 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 K7EMT4 169 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CORTO00230 105 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 NDUFA4O00483 81 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CTDSP2O14595 271 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 AKAIN1P0CW23 69 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 PGAM2P15259 253 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 GPR183P32249 361 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 MFAP2P55001 183 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 ISOC1Q96CN7 298 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 CITED4Q96RK1 184 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 ASCL2Q99929 193 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 PRRT1Q99946 306 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 SOSTQ9BQB4 213 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 SPATA25Q9BR10 227 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 COPZ2Q9P299 210 aa6.84□□□□□ -1.31
PKP4-218ENST00000629219 LYSTQ99698 3801 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 DBX1A6NMT0 343 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 C15orf62A8K5M9 175 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 DISC1C4P0D8 188 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 F8W735 103 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 H3BMQ9 156 aa6.83□□□□□ -1.32
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PKP4-218ENST00000629219 IGKV1-5P01602 117 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 DHODHQ02127 395 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 OR52E5Q8NH55 327 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 TP53RKQ96S44 253 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 NEURL2Q9BR09 285 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 NSG2Q9Y328 171 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.83□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-23P01764 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 AKR1C2P52895 323 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 PPP5CP53041 499 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 MFAP4P55083 255 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 CD81P60033 236 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 IL18Q14116 193 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 HAGHQ16775 308 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 BSXQ3C1V8 233 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 IL22RA2Q969J5 263 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 GALNT14Q96FL9 552 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 OR10C1Q96KK4 312 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 HINT2Q9BX68 163 aa6.82□□□□□ -1.32
PKP4-218ENST00000629219 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.82□□□□□ -1.32
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