RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-218	ENST00000568514	GPR107	Q5VW38	600 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		Q6P435	159 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		Q6ZSR3	168 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	DRAM1	Q8N682	238 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		Q8N7P7	452 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR1L1	Q8NH94	360 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OCR1	Q9BZK8	76 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR51E2	Q9H255	320 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PARP11	Q9NR21	331 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	AK3	Q9UIJ7	227 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	JPT1	Q9UK76	154 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PSG11	Q9UQ72	335 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ITPR3	Q14573	2671 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ITPR2	Q14571	2701 aa		2.56	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	C12orf77	C9JDV5	145 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		G3V4G9	280 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC22A1	O15245	554 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PIN1P1	O15428	100 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SOCS1	O15524	211 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FABP7	O15540	132 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC22A5	O76082	557 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR2F2	O95006	317 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR8U9	P0C7N5	309 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	DEFA4	P12838	97 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FOLR2	P14207	255 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	AZU1	P20160	251 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PRSS3	P35030	304 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FBN2	P35556	2912 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	LRBA	P50851	2863 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	EFNB2	P52799	333 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR10A3	P58181	314 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TAS2R46	P59540	309 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	KRTAP12-2	P59991	146 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CATR1	Q13166	79 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IL18	Q14116	193 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	LAGE3	Q14657	143 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		Q3ZCU0	254 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM104	Q8NE00	496 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR8U1	Q8NH10	309 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CLCC1	Q96S66	551 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	NICN1	Q9BSH3	213 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PECR	Q9BY49	303 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR2D2	Q9H210	308 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ENY2	Q9NPA8	101 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PRR34	Q9NV39	138 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		2.55	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	EHF	Q9NZC4	300 aa		2.55	□□□□□ -2

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