RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 A0A0G2JRQ6 117 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 FAM223BA6NKX1 122 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 H0Y980 276 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 BMPR1BO00238 502 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 OR2C1O95371 312 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 BRI3O95415 125 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 IGKV1-5P01602 117 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 OR5AC1P0C628 307 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 EDN2P20800 178 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 MFAP2P55001 183 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 RPEL1Q2QD12 228 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 TRIM16LQ309B1 348 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 ACSM6Q6P461 480 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 REC114Q7Z4M0 266 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 CCDC190Q86UF4 302 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 Q8N402 240 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 NECAP1Q8NC96 275 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 OR4A16Q8NH70 328 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 GPR132Q9UNW8 380 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-211ENST00000560941 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 C15orf61A6NNL5 157 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 SPNP16150 400 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ZP3P21754 424 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 AKR1C2P52895 323 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 TRIM63Q969Q1 353 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 TMEM230Q96A57 120 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 CCDC140Q96MF4 163 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 OR4C12Q96R67 309 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 PRRT1Q99946 306 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 NAA60Q9H7X0 242 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 PRNDQ9UKY0 176 aa6.27□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 A0A0B4J293 547 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 NXPH3O95157 252 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 DHFRP00374 187 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 IGHV3-48P01763 117 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 CLEC3BP05452 202 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 AKR1C4P17516 323 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 UCP1P25874 307 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ETV6P41212 452 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 BAK1Q16611 211 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 Q6ZRM9 215 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ZNF429Q86V71 674 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 TSC22D3Q99576 134 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 SRRQ9GZT4 340 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ZNF320A2RRD8 509 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ST8SIA3O43173 380 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 IFNA17P01571 189 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 CSN3P07498 182 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 P0C879 139 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 GPR183P32249 361 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ARL3P36405 182 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 INSL3P51460 131 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 TATDN3Q17R31 274 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.25□□□□□ -1.41
LINS1-211ENST00000560941 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms