RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-215ENST00000557654 IFNA5P01569 189 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 PPBPP02775 128 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 REG1AP05451 166 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 GALR1P47211 349 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 RAB7AP51149 207 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 DYNLT3P51808 116 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 CEBPGP53567 150 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 BPIFB3P59826 476 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 KISS1Q15726 138 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 CST6Q15828 149 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SP6Q3SY56 376 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 MORN2Q502X0 79 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 NMSQ5H8A3 153 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 GATSQ8NAP1 163 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR8B12Q8NGG6 310 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ZNF721Q8TF20 911 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TMEM234Q8WY98 164 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR1E3Q8WZA6 343 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ST8SIA1Q92185 356 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TBX15Q96SF7 602 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 GPER1Q99527 375 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 GABRG3Q99928 467 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR51I2Q9H344 312 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 RPRMQ9NS64 109 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 GNG13Q9P2W3 67 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 FANCMQ8IYD8 2048 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SCN2AQ99250 2005 aa3.12□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 EP400Q96L91 3159 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 F6UZH7 168 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TCF21O43680 179 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TMEM50AO95807 157 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OPN1LWP04000 364 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 CD55P08174 381 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 CTSEP14091 401 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 VDAC1P21796 283 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 CTRLP40313 264 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TPPP2P59282 170 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ERVS71-1P61550 626 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 RUNX1Q01196 453 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 FMODQ06828 376 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR5I1Q13606 314 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 PDGFRLQ15198 375 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ADIRFQ15847 76 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ZNF726P1Q15940 193 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SSX7Q7RTT5 188 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 LINC01551Q86U37 167 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TMEM123Q8N131 208 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 BATF2Q8N1L9 274 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 Q8N9L7 120 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 REEP6Q96HR9 211 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SLC35E1Q96K37 410 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SPACA5Q96QH8 159 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 TP53RKQ96S44 253 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 SPXQ9BT56 116 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 VAMP8Q9BV40 100 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.11□□□□□ -1.91
GPHN-215ENST00000557654 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.7 ms