RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 CDNFQ49AH0 187 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 Q56UQ5 140 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 Q6ZS49 121 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 OR4S2Q8NH73 311 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 HINT2Q9BX68 163 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 VSIRQ9H7M9 311 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM140Q9NV12 185 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 PTGES3LE9PB15 166 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 K7EQG2 157 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 CIB2O75838 187 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 YIF1AO95070 293 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 XGP55808 180 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SSX1Q16384 188 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 POU2AF1Q16633 256 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SPINK9Q5DT21 86 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 DCANP1Q8TF63 244 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A46Q96AG3 418 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 XCL2Q9UBD3 114 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB22AQ9UL26 194 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.78□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 ST8SIA3O43173 380 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 DIRAS3O95661 229 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 MT-CO2P00403 227 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 IFNA10P01566 189 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 IGKV1-39P01597 117 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 IGKV1D-39P04432 117 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 MIFP14174 115 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 HTN3P15516 51 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 FCGR2CP31995 323 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 G6PCP35575 357 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 HAMPP81172 84 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 SPHARQ15513 63 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 TTC23Q5W5X9 447 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 MS4A15Q8N5U1 240 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 OR51H1Q8NH63 302 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 DCSTAMPQ9H295 470 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 MDFICQ9P1T7 246 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 RABAC1Q9UI14 185 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 V9GY05 133 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 IRGMA1A4Y4 181 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 MEIS3P1A6NDR6 274 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 IFITM5A6NNB3 132 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 DHFRP00374 187 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 HRASP01112 189 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 HSMCR30P0CW71 290 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 CD36P16671 472 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 FXYD4P59646 89 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 HACD4Q5VWC8 232 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 STHQ8IWL8 128 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 FCAMRQ8WWV6 532 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 MISP3Q96FF7 219 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB40CQ96S21 281 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 COMMD5Q9GZQ3 224 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 ATG5Q9H1Y0 275 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.75□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 KRASP01116 189 aa4.75□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 PPYP01298 95 aa4.75□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 IGKV3-20P01619 116 aa4.75□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.75□□□□□ -1.65
CTDSP2-208ENST00000552294 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms