RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 A0A0B4J2A0 478 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 CGB1A6NKQ9 187 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 DBX1A6NMT0 343 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 C15orf61A6NNL5 157 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 TEX22C9J3V5 150 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 SOX15O60248 233 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 IGLV1-40P01703 118 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 GP9P14770 177 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 PSMB8P28062 276 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 FOXE3Q13461 319 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 TEX38Q6PEX7 206 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 LYG2Q86SG7 212 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 FAM219AQ8IW50 185 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 SLC35G3Q8N808 338 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 RNF152Q8N8N0 203 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 OR11H1Q8NG94 326 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 COMMD5Q9GZQ3 224 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PN81 502 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 ELANEP08246 267 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 CHRNA7P36544 502 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 DHRS2Q13268 280 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 C4orf46Q504U0 113 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 Q6ZRM9 215 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 OR5B3Q8NH48 314 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 OR4A16Q8NH70 328 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 PHB2Q99623 299 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 FAM110AQ9BQ89 295 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 OR51B2Q9Y5P1 312 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-231ENST00000552222 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 HMX3A6NHT5 357 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 APELAP0DMC3 54 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 FHL3Q13643 280 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 NMSQ5H8A3 153 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 ZNF429Q86V71 674 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 OR5T1Q8NG75 326 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 GPR146Q96CH1 333 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 GNB4Q9HAV0 340 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 SORL1Q92673 2214 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 BRI3O95415 125 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 AARDQ4LEZ3 155 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 PLET1Q6UQ28 207 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 OR52B4Q8NGK2 314 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 MITD1Q8WV92 249 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 DCUN1D4Q92564 292 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 KLK15Q9H2R5 256 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 CACNG5Q9UF02 275 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 H3BUA1 57 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 ST8SIA3O43173 380 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 SAP30O75446 220 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 LY6G6CO95867 125 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 IL5P05113 134 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 CRYGCP07315 174 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 AREGP15514 252 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 RAB9AP51151 201 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 TMEM65Q6PI78 240 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 Q8N1Y9 231 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 COQ8AQ8NI60 647 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 COA4Q9NYJ1 87 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 TMED3Q9Y3Q3 217 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GU03 582 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 SULT1A3P0DMM9 295 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 SULT1A4P0DMN0 295 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-231ENST00000552222 CTRB1P17538 263 aa10.55□□□□□ -0.72
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