RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	AP3S1	Q92572	193 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	EHF	Q9NZC4	300 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MARCH11	A6NNE9	402 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFA4	O00483	81 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RGS5	O15539	181 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	LY6G6C	O95867	125 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RLN1	P04808	185 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	F2R	P25116	425 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	BMI1	P35226	326 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	LPAR6	P43657	344 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MFAP2	P55001	183 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZWC4	215 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	LYG2	Q86SG7	212 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NSG2	Q9Y328	171 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2C	O00762	179 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SNAPC5	O75971	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	KRAS	P01116	189 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RFX2	P48378	723 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB135	Q30KP9	77 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MOB3A	Q96BX8	217 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ABHD1	Q96SE0	405 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NUPR2	A6NF83	97 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777		K7EMT4	169 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PMP2	P02689	132 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TNFSF8	P32971	234 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	G6PC	P35575	357 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	OR4C46	A6NHA9	309 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777		K7EIM0	57 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ADM	P35318	185 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777		Q56UQ5	140 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CADM3	Q8N126	398 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	RNF183	Q96D59	192 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM56	Q96MV1	263 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TAS2R46	P59540	309 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	GALNT14	Q96FL9	552 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PRND	Q9UKY0	176 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	GPR31	O00270	319 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CTSG	P08311	255 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	NAT1	P18440	290 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PRSS3	P35030	304 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	OR5B3	Q8NH48	314 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	OR52I2	Q8NH67	350 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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