RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MKXQ8IYA7 352 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 C9orf85Q96MD7 179 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TENM4Q6N022 2769 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 SHISA9B4DS77 424 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 F5H5P2 479 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 M0R036 132 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 MT-ND4P03905 459 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TCRBP04435 133 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR8U9P0C7N5 309 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CT45A6P0DMU7 189 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CT45A5P0DMU8 189 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CT45A7P0DMV0 189 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CD200P41217 278 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CAV2P51636 162 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CCR6P51684 374 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 BSPH1Q075Z2 132 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 ARL6IP1Q15041 203 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF146Q15072 292 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 MPPED2Q15777 294 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 MPV17LQ2QL34 196 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 SPRNQ5BIV9 151 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 Q6P435 159 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CHST4Q8NCG5 386 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR8U1Q8NH10 309 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 S100A13Q99584 98 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CA10Q9NS85 328 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CENPEQ02224 2701 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 C7orf66A4D0T2 115 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 C15orf61A6NNL5 157 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 F5H768 121 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CDIPTO14735 213 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 PDCD6O75340 191 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFB6O95139 128 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 NAPSAO96009 420 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 LHBP01229 141 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 FABP1P07148 127 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 AKAIN1P0CW23 69 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 FUT3P21217 361 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 GABRR1P24046 479 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 RCVRNP35243 200 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2E1P51965 193 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TAS2R31P59538 309 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TAS2R19P59542 299 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DS1Q14954 304 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR8G1Q15617 311 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 PLET1Q6UQ28 207 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZS49 121 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00596Q86U02 117 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 GAPTQ8N292 157 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR8S1Q8NH09 359 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 DTD1Q8TEA8 209 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.2□□□□□ -1.9
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