RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	GNG4	P50150	75 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF83	P51522	516 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF134	P52741	427 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ERVK-16	P61578	105 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5I1	Q13606	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB31	Q13636	194 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MORN2	Q502X0	79 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	UTF1	Q5T230	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	STPG4	Q8N801	248 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PRE2	83 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	HELT	A6NFD8	242 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MGST3	O14880	152 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PAX4	O43316	350 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF253	O75346	499 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	HYPM	O75409	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LYZL6	O75951	148 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TOMM40	O96008	361 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGFBP2	P18065	325 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CRYBB3	P26998	211 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CHRNB4	P30926	498 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PPOX	P50336	477 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB7A	P51149	207 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PRRX1	P54821	245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTDAP	P60985	99 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TBR1	Q16650	682 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZT83	130 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	S1PR3	Q99500	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms