RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.96□□□□□ -0.49
SERF1B-208ENST00000515588 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
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SERF1B-208ENST00000515588 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 TRIM16LQ309B1 348 aa11.95□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 PYDC2Q56P42 97 aa11.95□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 OR1P1Q8NH06 330 aa11.93□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.93□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.93□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 ATG12O94817 140 aa11.92□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 FOLR2P14207 255 aa11.92□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 ETV6P41212 452 aa11.92□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.92□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 ASCL2Q99929 193 aa11.92□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.91□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF320A2RRD8 509 aa11.91□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.91□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.91□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.91□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.9□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 SRRQ9GZT4 340 aa11.9□□□□□ -0.5
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SERF1B-208ENST00000515588 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.9□□□□□ -0.5
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF785A8K8V0 405 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 IGHV3-48P01763 117 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 AP3S2P59780 193 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 AARDQ4LEZ3 155 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 FAM219AQ8IW50 185 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 SLC35G3Q8N808 338 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 GPR146Q96CH1 333 aa11.89□□□□□ -0.51
SERF1B-208ENST00000515588 GALNT14Q96FL9 552 aa11.89□□□□□ -0.51
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