RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPWQ5EE01 88 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM90A1Q86YD7 464 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 HIST3H2BBQ8N257 126 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PIEZO1Q92508 2521 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXH1O75593 365 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PDPNQ86YL7 162 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MMD2Q8IY49 270 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PAXXQ9BUH6 204 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ACACBO00763 2458 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 C15orf62A8K5M9 175 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SRRM5B3KS81 715 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PLA2G2CQ5R387 149 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ATOH7Q8N100 152 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 GNB4Q9HAV0 340 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CA1P00915 261 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF224P0DH78 156 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTCAP3Q53RY4 240 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ATG101Q9BSB4 218 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PN81 502 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 HSBP1L1C9JCN9 74 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 WT1P19544 449 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 ABHD17AQ96GS6 310 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 PGPA6NDG6 321 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 DLX1P56177 255 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 EFNB3Q15768 340 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 GGTLC1Q9BX51 225 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 BSPH1Q075Z2 132 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC01560Q8TB33 94 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 YPEL1O60688 119 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV1-16P04430 117 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 CD3EP07766 207 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 ERVK11-1P61568 191 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 MMDQ15546 238 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM222BQ8WU58 562 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 YPEL2Q96QA6 119 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 CCKARP32238 428 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM256Q8N2U0 113 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GW64 132 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV3-15P01624 115 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 AMBPP02760 352 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 C8orf88P0DMB2 117 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 CD24P25063 80 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TCTAP57738 103 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZSR3 168 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 PYYP10082 97 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 SRIP30626 198 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 LEMD1Q68G75 181 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TIMD4Q96H15 378 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 MGST2Q99735 147 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV1-46P01743 117 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF134P52741 427 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 SPRNQ5BIV9 151 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC01551Q86U37 167 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8NFD4 153 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TNFRSF19Q9NS68 423 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 NAGKQ9UJ70 344 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM87AP0C7U9 286 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 CT45A10P0DMU9 189 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TIMP3P35625 211 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 GNB2P62879 340 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM19A2Q8N3H0 131 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 ARF6P62330 175 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 Q56UQ5 140 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 TCAPO15273 167 aa10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms