RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	HBE1	P02100	147 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	FGF7	P21781	194 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB11A	P62491	216 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	KPTN	Q9Y664	436 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508		F8W036	122 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	ADCYAP1	P18509	176 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB2A	P61019	212 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	KLRD1	Q13241	179 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	OR5B3	Q8NH48	314 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	SEC11C	Q9BY50	192 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PRD5	423 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PRF3	423 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PRM7	423 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508		M0R1W7	72 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	RRH	O14718	337 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	DLK1	P80370	383 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFA5	Q01523	94 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	MYOD1	P15172	320 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	COX7A1	P24310	79 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	NPY1R	P25929	384 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	PNKD	Q8N490	385 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508		C9JQL5	133 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV2-23	P01705	113 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	MB	P02144	154 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	IFNA4	P05014	189 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	LGALS7	P47929	136 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	RIPPLY3	P57055	190 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	CCL20	P78556	96 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	SVBP	Q8N300	66 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	TEX29	Q8N6K0	151 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508	VSIR	Q9H7M9	311 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GV50	99 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	MPDU1	O75352	247 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	CA2	P00918	260 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	M6PR	P20645	277 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	CD1B	P29016	333 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	LY6L	H3BQJ8	138 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	SOX15	O60248	233 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMEM18-208	ENST00000497508	PRTN3	P24158	256 aa		11.69	□□□□□ -0.54

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