RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	COPZ2	Q9P299	210 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		U3KQK5	164 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	TGOLN2	O43493	480 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ATG12	O94817	140 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	CLEC3B	P05452	202 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	FOLR2	P14207	255 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	UCP1	P25874	307 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	AKR1C2	P52895	323 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR1P1	Q8NH06	330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	MCFD2	Q8NI22	146 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ASCL2	Q99929	193 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	PRRT1	Q99946	306 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SOST	Q9BQB4	213 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		K7EIM0	57 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	EDN2	P20800	178 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	TNFSF8	P32971	234 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	OR2C3	Q8N628	320 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	FABP12	A6NFH5	140 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	CBLN1	P23435	193 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	TRIM16L	Q309B1	348 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	MARC2	Q969Z3	335 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	PALMD	Q9NP74	551 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327		A0A0B4J293	547 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF320	A2RRD8	509 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC160	A6NGH7	325 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327		I3L2K1	104 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	NDUFA4	O00483	81 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ST8SIA3	O43173	380 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	CDS2	O95674	445 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	SP6	Q3SY56	376 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	AARD	Q4LEZ3	155 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	SLC35G3	Q8N808	338 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	RCHY1	Q96PM5	261 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ZMAT4	Q9H898	229 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	MLX	Q9UH92	298 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327		V9GYH0	126 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	ADM	P35318	185 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	CD81	P60033	236 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	DHODH	Q02127	395 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM28-208	ENST00000495327	TM4SF20	Q53R12	229 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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