RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C21orf62Q9NYP8 219 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TBPP20226 339 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PIGPP57054 158 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RND3P61587 244 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CASC10Q5T4H9 136 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BTNL8Q6UX41 500 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTDSP2O14595 271 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C8orf88P0DMB2 117 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPCS2Q15005 226 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q56UQ5 140 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPSB3Q6PJ21 355 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR1P1Q8NH06 330 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 K7EIM0 57 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAB3DO95716 219 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPP5CP53041 499 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TAS2R19P59542 299 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR2C3Q8N628 320 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TERB2Q8NHR7 220 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ISOC1Q96CN7 298 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MISP3Q96FF7 219 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATP6V0BQ99437 205 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COPZ2Q9P299 210 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GABARAPH6UMI1 98 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CD74P04233 296 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRCDQ00LT1 54 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TP53RKQ96S44 253 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NDUFA4O00483 81 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATG12O94817 140 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RETNQ9HD89 108 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 F8W735 103 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGKV1-5P01602 117 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADMP35318 185 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKR1C2P52895 323 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MFAP4P55083 255 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRIM16LQ309B1 348 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SP6Q3SY56 376 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPINK9Q5DT21 86 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTSGP08311 255 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IL18Q14116 193 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MEF2DQ14814 521 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A0B4J293 547 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 I3L2K1 104 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 K7EMT4 169 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MT-CO2P00403 227 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IFNA17P01571 189 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3-48P01763 117 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNCAP37840 140 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms