RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493650.5

PCID2-215, Transcript of PCI domain containing 2, human

TSL 2

Gene PCID2, Length 4,202 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCID2-215	ENST00000493650	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	RHOB	P62745	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SLC25A4	P12235	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	APOC4	P55056	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	BATF	Q16520	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	NIT1	Q86X76	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	GPM6A	P51674	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	DLX6	P56179	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	NMES1	Q9C002	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650		A0A0A6YYD4	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	PDCD6	O75340	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	HBE1	P02100	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	CFP	P27918	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SULT1A1	P50225	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SULT1A2	P50226	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ZNF92	Q03936	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	PRDX4	Q13162	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SPINK2	P20155	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	F2R	P25116	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	FOXF2	Q12947	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	RHEB	Q15382	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	OR8B8	Q15620	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	RARRES2	Q99969	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	DEGS1	O15121	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	CD8A	P01732	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	CCL1	P22362	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	H3F3A	P84243	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ZNF345	Q14585	488 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650		F6UB75	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TAAR5	O14804	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	CD59	P13987	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	QRFP	P83859	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	CD164	Q04900	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCID2-215	ENST00000493650	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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