RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 GPER1Q99527 375 aa6.34□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 C3orf79P0CE67 100 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 FOXC2Q99958 501 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 SPATA25Q9BR10 227 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CENPMQ9NSP4 180 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 SIRPB1O00241 398 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 MPPED1O15442 326 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ADAM20O43506 726 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CBLN1P23435 193 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 PPOXP50336 477 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 FAM27E3Q08E93 113 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 NMSQ5H8A3 153 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 MUC21Q5SSG8 566 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 BLNKQ8WV28 456 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 MRAP2Q96G30 205 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 KCNS1Q96KK3 526 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 FOXB1Q99853 325 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 RAB1CQ92928 201 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.33□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PR80 420 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PS18 150 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 S1PR2O95136 353 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 HAND1O96004 215 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CCL1P22362 96 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 NPPCP23582 126 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 AMTP48728 403 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 STUMQ69YW2 141 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ZNF695Q8IW36 515 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ZNF525Q8N782 197 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CITED1Q99966 193 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 GNB4Q9HAV0 340 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ATRXP46100 2492 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 VWC2LB2RUY7 222 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 K7EQM0 130 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 RHOBP62745 196 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 RNF183Q96D59 192 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 MED29Q9NX70 200 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 H0YJW9 148 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 TNFSF12O43508 249 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CD40P25942 277 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 PSG4Q00888 419 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 KISS1Q15726 138 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 PRR31Q5SQ13 230 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 C5orf30Q96GV9 206 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.32□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 IGKV1D-33P01593 117 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 IGKV1-33P01594 117 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 VDAC1P21796 283 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 TGFBR3Q03167 851 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 HSD52Q0P140 79 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 GCM1Q9NP62 436 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 TMEM189A5PLL7 270 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CD5LO43866 347 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CA2P00918 260 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 SMIM17P0DL12 118 aa6.31□□□□□ -1.4
USP4-211ENST00000485450 CFHR2P36980 270 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms