RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 OR10Z1Q8NGY1 313 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 DUX3Q96PT4 197 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM222Q9H0R3 208 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 TAF9BQ9HBM6 251 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 OR5AC2Q9NZP5 309 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 AK3Q9UIJ7 227 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 H7C2Y5 167 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 M0R1W7 72 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ADAP1O75689 374 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SCO1O75880 301 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1D-12P01611 117 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR8U8P0C7N1 319 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 VDAC1P21796 283 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 FCGR2CP31995 323 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PIGPP57054 158 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 BAXQ07812 192 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 IL24Q13007 206 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PEA15Q15121 130 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ABCA11PQ4W5N1 156 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC10Q5BKY1 277 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF573Q86YE8 665 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 Q8IYB0 196 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR2C3Q8N628 320 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 Q8N7P7 452 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR4A4PQ8NGN8 299 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PIFOQ8TCI5 191 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF14Q92956 283 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SPACA5Q96QH8 159 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 MICU1Q9BPX6 476 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 NRIP2Q9BQI9 281 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 Q9N2K0 584 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SLC2A9Q9NRM0 540 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GPR173Q9NS66 373 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GU03 582 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 NUPR2A6NF83 97 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 MSGN1A6NI15 193 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF732B4DXR9 585 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TRDCB7Z8K6 153 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 F8W036 122 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GPR31O00270 319 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN4O14817 238 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 HSPA12AO43301 675 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PITX3O75364 302 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PPYP01298 95 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TK1P04183 234 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 HOXB5P09067 269 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GP9P14770 177 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ANOS1P23352 680 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GABRR1P24046 479 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 S100GP29377 79 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GNRHRP30968 328 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGDIBP52566 201 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R30P59541 319 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PAX5Q02548 391 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF266Q14584 549 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GNMTQ14749 295 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR2T2Q6IF00 324 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms