RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-204	ENST00000368210	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF137P	P52743	207 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	DLX1	P56177	255 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	CELA3B	P08861	270 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ADCYAP1	P18509	176 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	GAGE2B	Q13066	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	GAGE2E	Q4V326	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	NEU1	Q99519	415 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	DLL1	O00548	723 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF735	P0CB33	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	CD59	P13987	128 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ICAM4	Q14773	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	MYLK	Q15746	1914 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	GFRA3	O60609	400 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	CRYGS	P22914	178 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	RNF126	Q9BV68	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	CD40	P25942	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	RND2	P52198	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	GBF1	Q92538	1859 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210		A0A1B0GW64	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	APOM	O95445	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	GGN	Q86UU5	652 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210		M0R3E3	92 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	MUC15	Q8N387	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	CFAP161	Q6P656	301 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	TTC28	Q96AY4	2481 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210		A0A0A6YYD4	124 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	PLAU	P00749	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	FAM201A	Q5SY85	155 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	TDGF1	P13385	188 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-204	ENST00000368210	ADM	P35318	185 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	NOTCH4	Q99466	2003 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210		B9A039	149 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	ORM1	P02763	201 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	TSPO	P30536	169 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	TWIST1	Q15672	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-204	ENST00000368210	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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