RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TCF24Q7RTU0 167 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PIFOQ8TCI5 191 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 WFDC12Q8WWY7 111 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NABP2Q9BQ15 211 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZZEF1O43149 2961 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF737O75373 536 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CST7O76096 145 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 APOC4P55056 127 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZSR3 168 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TEX45Q8NA69 505 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DTD1Q8TEA8 209 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HSF4Q9ULV5 492 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 F5H697 171 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 F6UZH7 168 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PTTG1O95997 202 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CCR6P51684 374 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF429Q86V71 674 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N7P7 452 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPB3Q92617 1050 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf98A8MV24 154 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LDLRAD4O15165 306 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CTDSPLO15194 276 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ICMTO60725 284 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MPZP25189 248 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM50BP56557 158 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PSMG4Q5JS54 123 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM15Q7Z3B0 74 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IL22RA2Q969J5 263 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM160Q9NX00 188 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GVG6 124 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CCSO14618 274 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CNTFRP26992 372 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R45P59539 299 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB131AP59861 70 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 QRFPP83859 136 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS8Q16651 343 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FBLN7Q53RD9 439 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0A6YYD4 124 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SNURFLB1AK76 121 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HTR2BP41595 481 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NDPQ00604 133 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ASAH1Q13510 395 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-201ENST00000348564 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 GLMPQ8WWB7 406 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SOSTQ9BQB4 213 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TM2D1Q9BX74 207 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 K7EPK0 472 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FCN1O00602 326 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G10O15496 165 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HYPMO75409 117 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SPDEFO95238 335 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CAMLGP49069 296 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LYPD6Q86Y78 171 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.54□□□□□ -1.84
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