RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
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PTPRU-201ENST00000345512 TNFRSF19Q9NS68 423 aa12.92□□□□□ -0.34
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PTPRU-201ENST00000345512 TMEM144Q7Z5S9 345 aa12.9□□□□□ -0.34
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PTPRU-201ENST00000345512 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
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PTPRU-201ENST00000345512 CA1P00915 261 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
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PTPRU-201ENST00000345512 FCER1GP30273 86 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 HIGD1AQ9Y241 93 aa12.88□□□□□ -0.35
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PTPRU-201ENST00000345512 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00305Q7Z4B0 112 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 CD177Q8N6Q3 437 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 OR9G1Q8NH87 305 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 KCNS1Q96KK3 526 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-201ENST00000345512 WDR86Q86TI4 376 aa12.87□□□□□ -0.35
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