RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PLA2G10O15496 165 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 CDK2AP2O75956 126 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 SEC11BP0C7V7 166 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ZNF146Q15072 292 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 METRNQ9UJH8 293 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 SERF2P84101 59 aa8.93□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 TMEM186Q96B77 213 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 PRELID3AQ96N28 172 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 TSC2P49815 1807 aa8.93□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 EFEMP2O95967 443 aa8.93□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 ZP1P60852 638 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.93□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 IGHV1-2P23083 117 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 SPSB2Q99619 263 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 LEPP41159 167 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ERVK11-1P61568 191 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 COX19Q49B96 90 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 NBASA2RRP1 2371 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 LOXL4Q96JB6 756 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 KLRD1Q13241 179 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 GCHFRP30047 84 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 PTGDSP41222 190 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 NAT1P18440 290 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 UMODP07911 640 aa8.92□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 C7orf66A4D0T2 115 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 CTAG1AP78358 180 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 FUT5Q11128 374 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 DPM3Q9P2X0 92 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 NPIPB7O75200 414 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZT83 130 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ABCA4P78363 2273 aa8.91□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 ROS1P08922 2347 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 A0A0G2JLM5 398 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 LINC00614P0C842 121 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 AICDAQ9GZX7 198 aa8.91□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 C17orf98A8MV24 154 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 VENTXO95231 258 aa8.91□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 Q9H3A6 140 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.91□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 HOXA5P20719 270 aa8.9□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.9□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.9□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 LCTP09848 1927 aa8.9□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 MPTX1A8MV57 137 aa8.9□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 IFNL4K9M1U5 179 aa8.9□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ATP5LO75964 103 aa8.9□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 RPRMQ9NS64 109 aa8.9□□□□□ -0.98
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