RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PPB8 328 aa20.29■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PRS3 328 aa20.29■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.29■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 HAX1O00165 279 aa20.29■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 GDF15Q99988 308 aa20.29■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 DPM3Q9P2X0 92 aa20.29■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 LEPP41159 167 aa20.29■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf88Q9BSF0 95 aa20.29■□□□□ 0.84
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GNPTAB-201ENST00000299314 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa20.28■□□□□ 0.84
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GNPTAB-201ENST00000299314 TGFAP01135 160 aa20.28■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 IGKV1-13P0DP09 117 aa20.28■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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GNPTAB-201ENST00000299314 RTN4RL2Q86UN3 420 aa20.28■□□□□ 0.84
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GNPTAB-201ENST00000299314 FAM27E3Q08E93 113 aa20.27■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R27Q86WC6 154 aa20.27■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.27■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CKAP5Q14008 2032 aa20.27■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR19A6NJB7 356 aa20.27■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 IQCF6A8MYZ5 107 aa20.27■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BUT2 72 aa20.27■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 FGF16O43320 207 aa20.27■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMG4Q5JS54 123 aa20.27■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM90A1Q86YD7 464 aa20.27■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.26■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 H0YIZ8 118 aa20.26■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 LYZL4Q96KX0 146 aa20.26■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM144Q7Z5S9 345 aa20.26■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BRM9 83 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 IGHV1-2P23083 117 aa20.25■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 PGPEP1LA6NFU8 196 aa20.25■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2BOP23527 126 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2BBP33778 126 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2BDP58876 126 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2BCP62807 126 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST2H2BEQ16778 126 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2BHQ93079 126 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2BNQ99877 126 aa20.25■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2BMQ99879 126 aa20.25■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 UPK2O00526 184 aa20.24■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CELA3BP08861 270 aa20.24■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.24■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00312Q9Y6C7 94 aa20.24■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 C5orf30Q96GV9 206 aa20.24■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa20.24■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM50AO95807 157 aa20.24■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CD55P08174 381 aa20.24■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.23■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 C15orf61A6NNL5 157 aa20.23■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 RAMP3O60896 148 aa20.23■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 MPZP25189 248 aa20.23■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DUX3Q96PT4 197 aa20.23■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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GNPTAB-201ENST00000299314 PRR32B1ATL7 298 aa20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 LYPD3O95274 346 aa20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00271P0C7V0 271 aa20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM71F2Q6NXP2 309 aa20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 BEND2Q8NDZ0 799 aa20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 BSPH1Q075Z2 132 aa20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 WBP1Q96G27 269 aa20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DMRTA2Q96SC8 542 aa20.22■□□□□ 0.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CCL1P22362 96 aa20.22■□□□□ 0.83
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