RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM68Q96MH6 324 aa20.68■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 FBXL7Q9UJT9 491 aa20.68■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 GPX1P07203 203 aa20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 RPL19P84098 196 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 RNF114Q9Y508 228 aa20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 FXYD3Q14802 87 aa20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 WDR73Q6P4I2 378 aa20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 MOB3BQ86TA1 216 aa20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 LYG1Q8N1E2 194 aa20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF503Q96F45 646 aa20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 A6NNC1 897 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 MT-ND6P03923 174 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 BRS3P32247 399 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 OSTCQ9NRP0 149 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 J3QR06 171 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF83P51522 516 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 KRTDAPP60985 99 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 TIGITQ495A1 244 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM136Q6ZRR5 245 aa20.66■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 OR7C2O60412 319 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 SLC35B1P78383 322 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA1644Q3SXP7 199 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 PLEKHA3Q9HB20 300 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 LHBP01229 141 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM208Q9BTX3 173 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF586Q9NXT0 402 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 PRNDQ9UKY0 176 aa20.65■□□□□ 0.9
CTBP1-201ENST00000290921 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 TCL1AP56279 114 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 FAM201AQ5SY85 155 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 ADTRPQ96IZ2 230 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 OR10J3Q5JRS4 329 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 SEM1Q6ZVN7 128 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 SLC35E1Q96K37 410 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 GCM1Q9NP62 436 aa20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 GGTLC3B5MD39 225 aa20.63■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 POU2AF1Q16633 256 aa20.63■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 Q8N976 141 aa20.63■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa20.63■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 RAB9BQ9NP90 201 aa20.63■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 DSCAML1Q8TD84 2053 aa20.63■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 DSCAMO60469 2012 aa20.63■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 DIRC3C9JPN6 131 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 M0R1B8 84 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 DLEU1O43261 78 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 SPRY3O43610 288 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 PRCDQ00LT1 54 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 CYB5R2Q6BCY4 276 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 ITLN1Q8WWA0 313 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 NRN1Q9NPD7 142 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 ISLRO14498 428 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 GNG10P50151 68 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 COX19Q49B96 90 aa20.62■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 UPK2O00526 184 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 IGLV2-8P01709 118 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 OR5G3P0C626 314 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 AMTP48728 403 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 BATFQ16520 125 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 RCHY1Q96PM5 261 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 A0A1W2PS18 150 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 MGST1P10620 155 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 TAS2R45P59539 299 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF439Q8NDP4 499 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 OR4B1Q8NGF8 309 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 KCNS1Q96KK3 526 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 RNF2Q99496 336 aa20.61■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF253O75346 499 aa20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 AMY1AP04745 511 aa20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 MLANAQ16655 118 aa20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 VHLLQ6RSH7 139 aa20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 TANC2Q9HCD6 1990 aa20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 PMCHP20382 165 aa20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 SERTAD4Q9NUC0 356 aa20.6■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa20.59■□□□□ 0.89
CTBP1-201ENST00000290921 SRIP30626 198 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms