RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 HINT2Q9BX68 163 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TMEM167BQ9NRX6 74 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 MGAQ8IWI9 3026 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 URB1O60287 2271 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 RAB7AP51149 207 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 MZT1Q08AG7 82 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 FXYD3Q14802 87 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 MOB3BQ86TA1 216 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CORO2AQ92828 525 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CEP250Q9BV73 2442 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 FNDC10F2Z333 226 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IGHG3P01860 377 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 MT-ND6P03923 174 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 KRTDAPP60985 99 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SLC35B1P78383 322 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 OSTCQ9NRP0 149 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 OR51B2Q9Y5P1 312 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 ITGB1BP1O14713 200 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 OR10J3Q5JRS4 329 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 WDR73Q6P4I2 378 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 RCHY1Q96PM5 261 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.22□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GGTLC3B5MD39 225 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IGLV2-8P01709 118 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 NPSP0C0P6 89 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GAGE1Q13065 139 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 ZNF586Q9NXT0 402 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 PCNX2A6NKB5 2137 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PS18 150 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 DIRC3C9JPN6 131 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CD59P13987 128 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CFHR2P36980 270 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TCL1AP56279 114 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 BATFQ16520 125 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TIGITQ495A1 244 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 KCNS1Q96KK3 526 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 NRN1Q9NPD7 142 aa12.21□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 OR7C2O60412 319 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 AMTP48728 403 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 RPL19P84098 196 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 DHRS13Q6UX07 377 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 MOGAT3Q86VF5 341 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 LYG1Q8N1E2 194 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 RNF2Q99496 336 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 J3QR06 171 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ISLRO14498 428 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 CTRLP40313 264 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ZNF83P51522 516 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 POU2AF1Q16633 256 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 OR2V2Q96R30 315 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.2□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 BMPR1BO00238 502 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 OR5G3P0C626 314 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 PRCDQ00LT1 54 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 FAM201AQ5SY85 155 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 C1orf174Q8IYL3 243 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 SLC35E1Q96K37 410 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ZNF253O75346 499 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 LHBP01229 141 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 AMY1AP04745 511 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 PMCHP20382 165 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 SRIP30626 198 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 COX19Q49B96 90 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 GCM1Q9NP62 436 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 PRNDQ9UKY0 176 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 NBEAQ8NFP9 2946 aa12.19□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ATMQ13315 3056 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 PPOXP50336 477 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 MLANAQ16655 118 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ZNF439Q8NDP4 499 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 UPK2O00526 184 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 MGST1P10620 155 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 SPATA45Q537H7 98 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SYP-201ENST00000263233 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms