RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CTRB1	P17538	263 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	AKR1C2	P52895	323 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	AP3S2	P59780	193 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	C15orf61	A6NNL5	157 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	BRI3	O95415	125 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CRYGC	P07315	174 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	OR8U8	P0C7N1	319 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	DEFA4	P12838	97 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	AKR1C4	P17516	323 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	UCP1	P25874	307 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	INPP1	P49441	399 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	PRND	Q9UKY0	176 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CCR6	P51684	374 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A0B4J293	547 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CADM3	Q8N126	398 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	OVOL1	O14753	267 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	WIPF1	O43516	503 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CDS2	O95674	445 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003		P0C879	139 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	IL7	P13232	177 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	DHODH	Q02127	395 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM187	Q14656	261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003		Q6ZRM9	215 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	DHFR	P00374	187 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	FGF2	P09038	288 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	MFAP2	P55001	183 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5B3	Q8NH48	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ATG12	O94817	140 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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