RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CTDSP2	O14595	271 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD3D	P04234	171 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPR183	P32249	361 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	MFAP2	P55001	183 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CADM3	Q8N126	398 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	LGALS9	O00182	355 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	SERPINE2	P07093	398 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	FOLR2	P14207	255 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	PI3	P19957	117 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	PPP5C	P53041	499 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941		A8MWP6	167 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941		A8MZ25	164 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	RGS5	O15539	181 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	SNAPC5	O75971	98 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	PGAM2	P15259	253 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	S100G	P29377	79 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRND	Q9UKY0	176 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TPPP	O94811	219 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD74	P04233	296 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	IFNA6	P05013	189 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CLEC3B	P05452	202 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TBP	P20226	339 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	RND3	P61587	244 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	PIGP	P57054	158 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	THYN1	Q9P016	225 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941		K7EIM0	57 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD7	P09564	240 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	CBLN1	P23435	193 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	TAS2R19	P59542	299 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD81	P60033	236 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	MLX	Q9UH92	298 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	TGOLN2	O43493	480 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB3D	O95716	219 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMBIM6	P55061	237 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP3-215	ENST00000596941	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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