RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 COA4Q9NYJ1 87 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 GABARAPH6UMI1 98 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 K7EIL1 84 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 L7N2F9 121 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OVOL1O14753 267 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TNFSF12O43508 249 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 LY86O95711 162 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CRYGBP07316 175 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 AADACP22760 399 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 S100A11P31949 105 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2KP61086 200 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN5P62079 268 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 RUNX1Q01196 453 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 FHL3Q13643 280 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS8Q16651 343 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 DDB2Q92466 427 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 DCUN1D4Q92564 292 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 COL7A1Q02388 2944 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WW49 117 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0G2JLM5 398 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 H3BUA1 57 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SAP30O75446 220 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 PPYP01298 95 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS3P35030 304 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 INSL3P51460 131 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CCR6P51684 374 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SLURP1P55000 103 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R20P59543 309 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 HERV-K104P61576 105 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CD69Q07108 199 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TMUB2Q71RG4 321 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SSX9Q7RTT3 188 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM17Q86X19 198 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 MMD2Q8IY49 270 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OR4S2Q8NH73 311 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 RHOVQ96L33 236 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 GPHA2Q96T91 129 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 EHFQ9NZC4 300 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 HRASP01112 189 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV2-14P01704 120 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 PMP2P02689 132 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DS2P43631 304 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CATR1Q13166 79 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 MARC2Q969Z3 335 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OR4C12Q96R67 309 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 PRR25Q96S07 402 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SPIN2AQ99865 258 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SULT1C2O00338 296 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFB6O95139 128 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OR9G9P0C7N8 305 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 DEFA5Q01523 94 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 UQCC3Q6UW78 93 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF429Q86V71 674 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OR51H1Q8NH63 302 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 OR1S1Q8NH92 325 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-214ENST00000583153 USMG5Q96IX5 58 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms