RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556082.5

ATXN3-235, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-235ENST00000556082 OVOL3O00110 214 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATXN3-235ENST00000556082 AGPAT2O15120 278 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 IFNA10P01566 189 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 IGLV2-23P01705 113 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATXN3-235ENST00000556082 ADCYAP1P18509 176 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATXN3-235ENST00000556082 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.68□□□□□ -1.34
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ATXN3-235ENST00000556082 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 ABCA4P78363 2273 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 OOSP1A8MZH6 123 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-235ENST00000556082 CYB5BO43169 146 aa6.67□□□□□ -1.34
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