RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 C1orf159Q96HA4 380 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 TMPRSS2O15393 492 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 DLEU1O43261 78 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 PMCHP20382 165 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 VWC2Q2TAL6 325 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 RCHY1Q96PM5 261 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 M0R1X1 148 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 PCP4P48539 62 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 TMPRSS3P57727 454 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 ROS1P08922 2347 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 OOEPA6NGQ2 149 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 BRS3P32247 399 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 TPPP2P59282 170 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MMDQ15546 238 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 BTF3L4Q96K17 158 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 UHRF2Q96PU4 802 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 VAMP8Q9BV40 100 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 CD46P15529 392 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 ZNF134P52741 427 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MAJINQ3KP22 176 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 OR4A16Q8NH70 328 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 TAAR6Q96RI8 345 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 WNT10AQ9GZT5 417 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 GNB4Q9HAV0 340 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 STAG3L2P0CL84 134 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 STAG3L3P0CL85 134 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MDS2Q8NDY4 140 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 GNG12Q9UBI6 72 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 OR10J4P0C629 311 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 CRYBB3P26998 211 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 GPR12P47775 334 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MLANAQ16655 118 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 TNFSF13O75888 250 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 GCHFRP30047 84 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 EFNB3Q15768 340 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MMD2Q8IY49 270 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-214ENST00000543184 IGFBP2P18065 325 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 IGHV1-2P23083 117 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SPRNQ5BIV9 151 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 Q8IYB0 196 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 CD177Q8N6Q3 437 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 IL36BQ9NZH7 164 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 FAM201AQ5SY85 155 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 STPG3Q8N7X2 389 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 FLNCQ14315 2725 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 CXorf1O96002 111 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 CD99P14209 185 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 WDR82Q6UXN9 313 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 GCM1Q9NP62 436 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 PLXNB1O43157 2135 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TCF21O43680 179 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 NTF3P20783 257 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 LGALS4P56470 323 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 HTD2P86397 168 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms