RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542570.5

TOP3A-208, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3A, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-208ENST00000542570 PCSK4Q6UW60 755 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 P2RX4Q99571 388 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 DPM3Q9P2X0 92 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 NUDT19A8MXV4 375 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TIMM23O14925 209 aa8.38□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 ZNF90Q03938 601 aa8.38□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 GAFA1Q96PS6 74 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 MPZP25189 248 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 PDLIM4P50479 330 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 EML5Q05BV3 1969 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.37□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 AWAT1Q58HT5 328 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 OR2J3O76001 311 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 IGHV3-11P01762 117 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SEC11BP0C7V7 166 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 WFDC1Q9HC57 220 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM186Q96B77 213 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C1RLQ9NZP8 487 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CDK2AP1O14519 115 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 PITX3O75364 302 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV1-44P01699 117 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 LEMD1Q68G75 181 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SSX7Q7RTT5 188 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 LRP4O75096 1905 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 RD3LP0DJH9 198 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 IGFBP2P18065 325 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SULT1A2P50226 295 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 HMGN3Q15651 99 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SSX8Q7RTT4 187 aa8.36□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 IGLV3-1P01715 115 aa8.35□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 SPP1P10451 314 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF134P52741 427 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C18orf12Q96KH6 178 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 VSIRQ9H7M9 311 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 THYN1Q9P016 225 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 YPEL1O60688 119 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 FAM106CPP0CH98 169 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ATP6V1FQ16864 119 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ASCL4Q6XD76 172 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 YPEL2Q96QA6 119 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CAMPP49913 170 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CCL20P78556 96 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.35□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 FAM74A7A6NL05 159 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CSN1S1P47710 185 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 H3BQ15 152 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 RND3P61587 244 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF383Q8NA42 475 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 NAGKQ9UJ70 344 aa8.34□□□□□ -1.07
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