RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 AWAT1Q58HT5 328 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRB-204ENST00000538708 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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PTPRB-204ENST00000538708 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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PTPRB-204ENST00000538708 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRB-204ENST00000538708 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 M0R1W7 72 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRB-204ENST00000538708 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 IGHG3P01860 377 aa7.89□□□□□ -1.15
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