RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524725.5

TMEM25-208, Transcript of transmembrane protein 25, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TMEM25, Length 2,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-208	ENST00000524725	CGA	P01215	116 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	IGLV1-44	P01699	117 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	GCHFR	P30047	84 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TIMP3	P35625	211 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TAS2R60	P59551	318 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	FOXL1	Q12952	345 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	EFNB3	Q15768	340 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	AARD	Q4LEZ3	155 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	STPG3	Q8N7X2	389 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MGST3	O14880	152 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	SPRY3	O43610	288 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	CD99	P14209	185 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	IGFBP2	P18065	325 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	CA2	P00918	260 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	OR5I1	Q13606	314 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ATG101	Q9BSB4	218 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	GNG10	P50151	68 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ZNF90	Q03938	601 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ATRX	P46100	2492 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	NPY1R	P25929	384 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	CCKAR	P32238	428 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	DDB2	Q92466	427 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MS4A10	Q96PG2	267 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	C15orf61	A6NNL5	157 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725		F2Z2F3	143 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	SPINK4	O60575	86 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	PCP4	P48539	62 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TMPRSS3	P57727	454 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	F2RL2	O00254	374 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MLANA	Q16655	118 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	ROS1	P08922	2347 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725		K7ENP7	123 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	LINC00310	P59036	64 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	RAB4B	P61018	213 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	RHOB	P62745	196 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TDRG1	Q3Y452	100 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TMEM25-208	ENST00000524725	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TMEM25-208	ENST00000524725	MMP23A	O75900	390 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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